[YAM1966]

И что с того? Перед обращением спрашиваем тип? Возвращает не наш - опрашиваем все порты и составляем таблицу соответствия номера COM порта и типа ардуины.
И далее используем ее до момента описанного выше.

p.s. Или такой вариант:
По USB к компу подключается только одна ардуина, остальные подключаются к ней параллельно сигналам RXD и TXD.
При этом TXD каждой активируется только при передаче ответа, в остальное время нога настроена на вход с подтяжкой к питанию.
Т.е. слушают все одновременно, а отвечает или исполняет команды только запрашиваемая.