[vladj]

В вопросе не прозвучало, а зачем это нужно, обрезать ? "грузится фактически не винда, а сразу оболочка" тут виден сразу конечно опыт топикстартёра.
Программы есть для обрезания винды, они общеизвестны и бесплатны nLite для ХР и vLite для 7-8 винды. С ХР проще резать, с 7-8 намного сложней.
Обрезание в большинстве делается для уменьшения размера удалением не нужных драйверов, программ, небольшого твика работы Оси.
Если только для уменьшения размера, то при нынешних хардах это сомнительное занятие. Лучше оптимизировать процессы, отключить что-то не нужное и т.д.
И чего так нервирует рабочий стол, он мизер отнимает, особенно если убрать с него все до одного ярлыки и картинку. имхо.