щелчки - это как раз ошибки передачи, т.к. ваш кабель как раз на грани возможного по стандарту работает. ищите возможность укоротить, либо заменить на очень хорошего качества с маркировкой 20AWG, ферритовыми кольцами и т.д. и т.п. -
поищите в интернете, все давно расписано о премудростях длинных USB кабелей (правда в продаже таких нету, искали уже...).
Да, есть еще кабеля-повторители, или USB-extenders, там репитеры встроены, что позволяет перепрыгнуть ограничения стандарта. Аудиофилы одобрили эти штуки, но цена вопроса уже побольше.
Как метод борьбы - можно ограничить в UAPP разрядность и частоту до 16/44,1. Тогда уменьшится поток и проблема может меньше проявляться.
Лучший метод с точки зрения дальности и помехозащищенности в авто - 5-метровая оптика. И на процессор ее (если есть такой).
Вот удлинитель-повторитель недорогой у китайцев.