Я предлагаю подать питание на плату, как описано здесь
http://www.taker.im/phpBB2/topic/137...0#entry2239096
При этом можно будет пользоваться usb-разъемом для подключения внешних устройств в режиме otg, и попутно устранится проблема с разрядом аккумулятора за счет изменения режима работы контроллера питания. Ну а можно ограничиться отключением зарядного устройства через реле при отсутствии 12В.